Ещё в детстве Зегер исполнял сопрановые партии в знаменитом хоре собора Святой Бавоны в своём родном Генте. Позже изучал технику „лёгкого тенора“ (Tenore leggiero) в местной Музыкальной академии. Учился пению у известных вокальных педагогов в Бельгии, Италии, Германии и Австрии.   Зегер Вандерстеен широко известен своими интерпретациями произведений композиторов различных эпох и стилей: от Средневековой музыки, Возрождения и Барокко до современных сочинений.
   Певец записал большое количество компакт-дисков, выступал с сольными программами и участвовал в оперных постановках в странах Восточной и Западной Европы, в США, Южной Америки, Мексики и Японии.
  Среди известных дирижёров, с которыми выступал Зегер Вандерстеен, — Франц Брюгген, Николас Харнонкурт, Рафаэль Фрюбек, Джон Причард, Рене Клеменсис, Рудольф Кельтерборн и другие. Начиная с 1995 года, музыкант часто и с большим успехом гастролирует в самых значительных концертных залах Японии.